Trường Tiểu học - THCS - THPT Hai Bà Trưng hướng đến mục tiêu giúp học sinh phát triển đầy đủ 8 loại Trí thông minh (theo sở thích và tố chất cá nhân) bên cạnh việc tạo lập, phát triển toàn diện theo 4 trụ cột VĂN - KỸ - THỂ - MỸ (hiểu biết văn hoá - xã hội, kỹ năng, thể chất, khả năng cảm thụ cái đẹp).
Mục tiêu giáo dục nền tảng này sẽ được cụ thể hóa cho từng cấp học nhưng đảm bảo tính liên thông giữa các cấp để giúp cho học sinh có được một lộ trình phát triển và học tập thống nhất theo các các triết lý, giá trị cũng như phương pháp giáo dục phù hợp, có tính cá thể hóa trong suốt 12 năm học tại trường.